第二次鸦片战争期间，沙俄强迫清政府签订《中俄瑷珲条约》，夺去黑龙江以北约63万平方公里土地，1860年又强迫签订《北京条约》，约定中俄东段边界以黑龙江、乌苏里江为界，黑龙江以北、乌苏里江以东划归俄国；原住这一地区的中国人，仍准留住。这一条约又强行割占了中国领土40多万平方公里。1929年，中国东北当局将中东铁路电报电话权收回，将苏联职员遣送回国，就此引发了中苏争夺中东铁路所有权的大规模武装冲突。最后中国战败。当年12月20日，张学良派代表与苏方签订《伯力协定》。中国领土黑瞎子岛就是在该次武装冲突期间被苏联红军占领的。这是历史上中苏之间发生的规模最大的一场鲜为人知的“冲突”。结果是“中东铁路事件”回到了原点，即苏联人又重新“获得”了在中东铁路的“工作权”。但是，好端端的中国领土——黑瞎子岛，却从此成为苏联的囊中之物！在上世纪50年代末以前，中国人上下黑瞎子岛并不受限制。待中苏关系交恶后，中苏边防部队，都加强了对黑瞎子岛周边的戒备。从那时候起，中国人就不能登岛了。
黑瞎子岛满语名字叫摩乌珠岛，意思是“马头”。
据抚远县志记载，公元1411到1433年间，明朝著名的太监亦失哈曾先后十次率大规模船队经过黑瞎子岛，到黑龙江上游巡视。公元1854年，清政府在岛东北角设立了乌苏里昂哥卡伦(边防哨卡)。1901年冯德禄、葛云山、德夫克(赫哲族)等15户人家上岛居住。1927年，抚远县居民朱瑞臣一家5口人搬到黑瞎子岛居住，养马两匹，种地若干。1929年“中东路事件”后，朱瑞臣等住户被迫陆续从黑瞎子岛上搬下来。
1929年，张学良为夺回沙俄在东北修筑的中东铁路路权，与原苏联发生战争，史称“中东路事变”。
抚远县志记载：1929年9月6日下午1时，苏军向乌苏镇发动全面进攻，中国东北军第九旅42团2营7、8两个连的官兵在营副官国占奎的指挥下奋起反抗，战斗到傍晚，终因寡不敌众，乌苏镇失守，中国守军百余人全部阵亡。乌苏镇在苏军的炮火中变成一片废墟。
此后，双方20万人激战月余，东北军全面溃败，原苏联顺势占领了黑瞎子岛，造成日后中俄之间最难解决的问题之一。
黑瞎子岛以东是俄罗斯远东第一大城市哈巴罗夫斯克，中国古代称“伯力”。
由于哈巴罗夫斯克紧邻黑瞎子岛，是黑龙江和乌苏里江的门户，所以具有重要的战略地位。它又是黑龙江出海通道的扼口，经哈巴罗夫斯克顺黑龙江直下，可直达庙街，过鞑靼海峡，再抵库页岛。与此同时，哈巴罗夫斯克又是西伯利亚大铁路通往海参崴的咽喉。
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